檢測是凈化工程建設之后比較重要的一個項目，在檢測凈化工程過程中，有部分潔凈度檢測不合格，有的是廠房局部（part)，也有整個工程。實驗室通風供排系統完善的實驗室，是一個環境和諧、安全、健康的工作場所。實驗室壓力、噪音、房間的換氣次數、氣流組織、通風柜有毒氣體殘留等都是值得關注的問題。如果檢測不合格，雖然甲乙雙方通過整改、調試、清沽等。費勁千辛萬苦達到了工程的要求，但是卻浪費了大量的人力和物力。不僅耽誤了整個工程的工期，最重要的是延誤了GMP認證的進程，這就有些得不償失了。其實，有些原因和缺陷在檢測前是完全可以避免的。據多年經驗（experience)了解到，造成凈化工程潔凈度不合格的主要原因有：
1.凈化工程的設計不合理
這種現象比較少見，主要是在一些小型的凈化級別要求不太高的潔凈室建造上。現在凈化的競爭比較激烈，一些施工單位為了得到工程，在投標中給出了較低的報價(quotation)。在凈化工程的后期施工中，利用一些單位不太懂行的情況，偷工減料，使用功率(指物體在單位時間內所做的功的多少)較低的空調通風壓(wind pressure)縮機(compressor)組，使送風功率與凈化面積不匹配，導致潔凈度不合格。
2.用低檔產品替代（用一物質代替另一物質（多為強者取代弱者的地位))高檔產品
在潔凈室高效過濾器(作用:過濾雜質等)的應用上，國家規定在潔凈度10萬級或高于10萬級以上的空氣凈化處理，應采用初效、中效、高效過濾器的三級過濾。而筆者在驗證(Experimental)過程中，曾發現某大型凈化工程在l萬級的凈化級別上采用亞高效空氣過濾器代替高效空氣過濾器，從而造成了潔凈度不合格。最終更換了高效過濾器才符合了GMP認證的要求。
3.回風管道或回風口設計、調試不好
在設計方面的原因，有時因空間所限未能采用“頂送側回”或者回風口數量不夠，在設計方面的原因排除（Remove)后，回風口的調試也是重要的工工環節。實驗室通風供排系統完善的實驗室，是一個環境和諧、安全、健康的工作場所。實驗室壓力、噪音、房間的換氣次數、氣流組織、通風柜有毒氣體殘留等都是值得關注的問題。如果調試不好，回風口阻力過大，回風量(定義:單位時間內空氣的流通量)小于送風量，也會造成潔凈度不合格。另外在施工中，回風口離地面的高度對潔凈度也有影響。
4.凈化空調系統沒有清掃干凈
凈化工程在施工過程中，整個凈化空調系統，尤其是送、回風管道都不是一次完成，施工人員和工環境都會造成通風管道和過濾器(作用:過濾雜質等)的污染。實驗臺框架一般采用C型方型鋼，可靠焊接，經酸洗磷化、電泳后，實驗臺表面經環氧樹脂高壓靜電粉沫噴涂，高溫固化處理。具有良好的防腐性能，緊密強固，承重力強。如不清潔干凈，將直接影響凈化工程的檢測結果。改進措施（指針對問題的解決辦法)是，邊施工邊清潔，面前一段管道安裝完成徹底清潔后，可用塑料（結構:合成樹脂、增塑劑、穩定劑、色料)薄膜(薄而軟的透明薄片)密封，避免環境等造成的污染。
5.潔凈廠房清涪不徹底（thorough)
毋庸置疑(不必懷疑、沒有懷疑的余地)，凈化工程在檢測前必須徹底全面清掃，才能進行檢測。要求最后的擦拭人員，身著潔凈工作服進行清掃，以排除（Remove)清掃人員人體造成的污染。清洗劑可以選用自來水、純水、有機溶劑(性狀:透明、無色的液體)、中性洗滌(washing)劑等。