病理實驗被稱之為“醫之本”，但長期以來因為種種原因，病理實驗工作者的都在一個相當惡劣的工作環境中工作。病理實驗過程中的甲基苯(methylbenzene)（化學式：C6H6） 、二甲苯（dimethylbenzene）、福爾馬林、脫水試劑、染色試劑以及包埋石蠟等各種有毒、有刺激性氣味充實于整個實驗流程中。其中苯類有機揮發物如果長期吸入過量可能導致人體內白細胞數量的銳減，從而導致白血病。 
    要解決這些問題，就必須對病理實驗室進行科學的規劃(設計大工程或作計劃)和建設。如：將診斷辦公區與實驗區分成兩個區域，診斷辦公區宜靠南面，實驗區宜靠北面。為標本保存、取材、脫水、包埋、染色等可能產生有毒、有刺激性氣味的實驗過程，采用通風設備加以保護，降低實驗室有毒有害氣體的含量。同時病理實驗室是一個有序的流程，合理的安排不同的功能不僅有利于實驗室的管理(guǎn lǐ)，也有利于工作效率的提高。

為保證檢測工作的安全，生物安全實驗室應符合BSL-2級實驗室的要求，在生物安全實驗室的出口處應設有非手動洗手裝置和緊急洗眼裝置，部分高污染風險(risk)的工作應在二級生物安全柜內進行。  
（1）HIV初篩實驗室：分為清潔區、半污染區、污染區，面積不宜小于45㎡。  
（2）PCR實驗室：分為試劑準備(ready)室、樣品制備室、擴增分析室，各實驗室前要有緩沖間，PCR總面積不宜小于60㎡。  
（3）微生物實驗室：分為準備室、緩沖間和工作區，面積不宜小于35㎡。  

（4）采血區應單獨成一區，采血窗口的長度不宜小于1.2m，寬度45-1500px為宜，采血窗口的數量應參考日平均門診數量確定，并適當考慮將來發展需要。PCR實驗室國家實驗室代表國家最高水平，是按國際一流標準建立的，規模非常大，基本包括本學科領域所有研究方向，而且人員配備上要求面向國內外招聘最優秀的研究人員，直接參與國際競爭，往往是多學科交叉的創新平臺。動物（SPF級）實驗室實驗脊椎動物生物安全防護實驗室，其適用微生物范圍與同級的一般生物安全防護實驗室相同。（5）生化區在設計時應重點關注生化機，生化機的更新換代速度很快，在設計前應與設備廠家聯系，確定設備的擺放位置、規格、重量、功率、用水量等參數。
實驗（experiment)室建設前應根據微生物和生物醫學實驗室生物安全通用準則、GB19489-2008實驗室生物安全通用要求、病原微生物實驗室生物安全管理條例（國務院424號令）進行生物安全評估，確定實驗室是否需要凈化以及凈化等級〔2-4〕。
評估結果：自動化實驗室防護水平應不低于BSL-2級實驗室要求，實際設計中實驗室各項指標（target aim)完全符合BSL-2實驗室要求，包括明確標識、獨立更衣室、獨立庫房，配備了洗眼器、高壓蒸汽滅菌器及應急工具。生物實驗室結構和設施、安全操作規程、安全設備適用于主要通過呼吸途徑使人傳染上嚴重的甚至是致死疾病的致病微生物及其毒素，通常已有預防傳染的疫苗。此外還在設計中參考了BSL-3實驗室建設的部分要求[5]。樓層高度不小于2.6m，實驗室內通道凈寬不小于1.5m，門寬度不小于1m，同時門的高度與寬度應方便實驗室內儀器運輸，建成后實驗室門禁系統、換氣頻率(frequency)、溫濕度控制等部分指標達到了BSL-3級實驗室水平。