疾控中心實驗室建設要符合國家現行的有關生物安全標準。  
疾控中心實驗室的空氣具有潔凈度的要求，潔凈等級按病原性微生物實驗和感染程度確定，其地理位置應選擇(xuanze)遠離人煙稠密、交通繁忙和空氣、水源、噪聲嚴重污染地區。實驗室家具即進行試驗的場所。實驗室是科學的搖籃，是科學研究的基地，科技發展的源泉，對科技發展起著非常重要的作用。疾控中心實驗室要按照功能用途劃區布置，將實驗室與各區嚴格分開，人流、物流路徑分明，有污染排放的區域要設在實驗室的下風向，吸風口設在上風向，實驗室周圍不宜種植飛揚花粉、絨毛和落葉的植物。  
疾控中心實驗室不同于其他醫療工程。其區別在于，不僅要求防止環境因素對實驗室的污染和實驗之間的交叉污染，同時還要防止實驗過程中所使用的生物危害和潛在生物危害不致向周圍環境釋放造成污染。
疾控中心實驗室設計建設原則：
節能降耗
對于溫場均勻、波動度小、控溫要求高的實驗室，為降低實驗室耗能，宜將溫度（temperature)要求相同或接近的實驗室布置在同一樓層鄰近房間，由恒溫恒濕控制系統的同一機組控制。實驗室設計實驗脊椎動物生物安全防護實驗室，其適用微生物范圍與同級的一般生物安全防護實驗室相同。此外，加厚外墻、采用雙層密封玻璃材質、安裝閉門器等均有助于實驗室恒溫而達到節能的效果。
安全環保
對于危險性的(如石油、有機、高壓)以及防爆實驗室的門應向外開。實驗室通風結構和設施、安全操作規程、安全設備適用于對健康成年人已知無致病作用的微生物，如用于教學的普通微生物實驗室等。只要允許，門上可設一玻璃觀察窗，以便值班人員進行安全觀察。易燃、易爆、強氧化（oxidation)物和還原劑類藥品應保存在通風、陰涼、干燥、遠離熱(火)源的地方；化學試劑分類存放；有毒有害物品則專柜存放。對實驗中發生有毒有害氣體的操作控制，則必須在通風櫥內進行，為此設計時應考慮通風櫥的位置（position )。使用各種高壓儲氣瓶時，應使用鐵環等固定器材將其穩固在支架或墻壁上，防止因觸碰而翻到。
留有余地
考慮到今后實驗（experiment)室拓展檢測/校準項目的需要，實驗室的供電容量應留有余地；除常用的220V供電電源以外，還應考慮380V的電源供電；由于燈的效率(efficiency)和房間墻面反射率不斷衰減，設計照度應大于標準照度等。
操作方便
例如有的設備是常年運轉的(如烘箱、恒溫箱、冰箱等)，為此，應提供專用電源，有的設備是實驗過程中使用，當實驗結束時機器即停止使用，對這些設備實驗室可設置總開關，確保實驗人員離開時統一切斷電源。為利于操作控制，實驗臺寬度一般為0.75m，按兩人能在兩邊坐著或者站著做實驗，中間可走動一個人計算，兩排實驗臺之間的凈距宜為1.5m～1.8m。